Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fchsd2Q3USJ8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms