Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc34Q3UI66 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms