Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ap5b1Q3TAP4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms