Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms