Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms