Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VldlrP98156 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VldlrP98156 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms