Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms