Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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