Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms