Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc10P31257 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc10P31257 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms