Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hoxd10P28359 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd10P28359 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd10P28359 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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