Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms