Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Fcer1aP20489 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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