Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms