Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms