Protein–RNA interactions for Protein: P04945

Ig kappa chain V-VI region NQ2-6.1, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04945 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04945 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04945 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04945 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04945 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04945 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04945 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04945 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04945 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04945 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04945 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04945 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04945 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04945 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04945 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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