Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgceO70258 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgceO70258 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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