Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smad6O35182 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smad6O35182 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms