Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3542K7N6U2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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