Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm44848-201ENSMUST00000207808 3234 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tnmd-201ENSMUST00000033602 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Sfmbt2-203ENSMUST00000114862 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm20921-201ENSMUST00000188265 652 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms