Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms