Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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