Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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