Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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