Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms