Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Nubp2Q9R061 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Nubp2Q9R061 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Nubp2Q9R061 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nubp2Q9R061 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nubp2Q9R061 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nubp2Q9R061 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nubp2Q9R061 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nubp2Q9R061 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nubp2Q9R061 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
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