Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms