Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ap3b2Q9JME5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3b2Q9JME5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms