Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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