Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ldb3Q9JKS4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms