Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms