Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4aQ9ER60 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn4aQ9ER60 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms