Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms