Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms