Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms