Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atp5f1Q9CQQ7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atp5f1Q9CQQ7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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