Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nsmce3Q9CPR8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nsmce3Q9CPR8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nsmce3Q9CPR8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Nsmce3Q9CPR8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nsmce3Q9CPR8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms