Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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