Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms