Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc8Q8VD72 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms