Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops8Q8VBV7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops8Q8VBV7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops8Q8VBV7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops8Q8VBV7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops8Q8VBV7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops8Q8VBV7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops8Q8VBV7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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