Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L0

Ddx54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx54Q8K4L0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx54Q8K4L0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx54Q8K4L0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx54Q8K4L0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx54Q8K4L0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx54Q8K4L0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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