Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms