Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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