Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms