Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms