Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms