Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ubash3bQ8BGG7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ubash3bQ8BGG7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ubash3bQ8BGG7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ubash3bQ8BGG7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ubash3bQ8BGG7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubash3bQ8BGG7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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