Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms