Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dsg1bQ7TSF1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dsg1bQ7TSF1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dsg1bQ7TSF1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dsg1bQ7TSF1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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